8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_69908
Cell Name :  YF12002_4001-5000_bright452
Archive Name :  Zeng
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-YFP-H
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  21.0 days
Max Age :  21.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  10.77 grams
Max Weight :  10.77 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  NeuroGPS-Tree.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  yellow fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  1  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  Not reported
Magnification :  Not reported
Reconstruction Method :  NeuroGPS-Tree
Date of Deposition :  2015-01-16
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  YF12002_4001-5000_bright452.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  NeuroGPS-Tree: automatic reconstruction of large-scale neuronal populations with dense neurites.

Measurements
Soma Surface :  1994.6 μm2
Number of Stems :  15
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  73
Overall Width :  240.55 μm
Overall Height :  528.07 μm
Overall Depth :  142.07 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  3741.41 μm
Total Surface :  11754 μm2
Total Volume :  2938.49 μm3
Max Euclidean Distance :  498.99 μm
Max Path Distance :  576.45 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  3579
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  49.72°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.19°
Fractal Dimension :  1.05

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