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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_80402
Cell Name :  XCK980-2_1
Archive Name :  Zoghbi
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  parietal
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  ATXN1-knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-04-29
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  XCK980-2_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Disruption of the ATXN1-CIC complex causes a spectrum of neurobehavioral phenotypes in mice and humans.

Measurements
Soma Surface :  1470.08 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  63
Overall Width :  207.52 μm
Overall Height :  207.56 μm
Overall Depth :  70.3 μm
Average Diameter :  1.44 μm
Total Length :  2426.32 μm
Total Surface :  11588.4 μm2
Total Volume :  6226.94 μm3
Max Euclidean Distance :  158.3 μm
Max Path Distance :  185.61 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  1836
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.71
Average Bifurcation Angle Local :  65.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.16°
Fractal Dimension :  1.02

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