8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_80401
Cell Name :  XCK972-3_1
Archive Name :  Zoghbi
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 month
Max Age :  1.0 month
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  parietal
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  ATXN1-knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-04-29
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  XCK972-3_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Disruption of the ATXN1-CIC complex causes a spectrum of neurobehavioral phenotypes in mice and humans.

Measurements
Soma Surface :  896.4 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  88
Overall Width :  162.97 μm
Overall Height :  171.91 μm
Overall Depth :  59.19 μm
Average Diameter :  1.06 μm
Total Length :  2655.98 μm
Total Surface :  9189.8 μm2
Total Volume :  3619.48 μm3
Max Euclidean Distance :  137.98 μm
Max Path Distance :  183.52 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  1962
Partition Asymmetry :  0.5
Average Rall's Ratio :  1.66
Average Bifurcation Angle Local :  58.17°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.24°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website