8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_150662
Cell Name :  X073-S5-Z4-C01-exported-000
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6-Itgb3tm1.1Wlbcr/J x h B6.129S2-Emx1tm1(cre)Krj/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Integrin subunit beta 3 (Itgb3) Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2021-01-06
Date of Upload :  2021-02-18
Persistence Vector :  X073-S5-Z4-C01-exported-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Integrin β3 organizes dendritic complexity of cerebral cortical pyramidal neurons along a tangential gradient.

Measurements
Soma Surface :  197.7 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  45
Overall Width :  224.59 μm
Overall Height :  374.78 μm
Overall Depth :  30.98 μm
Average Diameter :  2.23 μm
Total Length :  1986.62 μm
Total Surface :  14002.4 μm2
Total Volume :  8406.38 μm3
Max Euclidean Distance :  340.55 μm
Max Path Distance :  348.54 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  581
Partition Asymmetry :  0.39
Average Rall's Ratio :  2.06
Average Bifurcation Angle Local :  33.65°
Average Bifurcation Angle Remote :  79.49°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website