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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107582
Cell Name :  X046_S5_Z5_C02
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-01-03
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  X046_S5_Z5_C02.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cross-Regional Gradient of Dendritic Morphology in Isochronically-Sourced Mouse Supragranular Pyramidal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  135.04 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  39
Overall Width :  229.5 μm
Overall Height :  239.51 μm
Overall Depth :  37.77 μm
Average Diameter :  1.89 μm
Total Length :  2047.19 μm
Total Surface :  12282 μm2
Total Volume :  6168.79 μm3
Max Euclidean Distance :  189.48 μm
Max Path Distance :  224.01 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  626
Partition Asymmetry :  0.37
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  10.4°
Average Bifurcation Angle Remote :  58.24°
Fractal Dimension :  1.01

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