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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107649
Cell Name :  X046_S1_Z2_C03
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-01-03
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  X046_S1_Z2_C03.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cross-Regional Gradient of Dendritic Morphology in Isochronically-Sourced Mouse Supragranular Pyramidal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  90.32 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  11
Number of Branches :  26
Overall Width :  217.67 μm
Overall Height :  384.22 μm
Overall Depth :  27.86 μm
Average Diameter :  2.03 μm
Total Length :  1686.74 μm
Total Surface :  10852.2 μm2
Total Volume :  5722.96 μm3
Max Euclidean Distance :  289.54 μm
Max Path Distance :  308.06 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  522
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.98
Average Bifurcation Angle Local :  35.67°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.92°
Fractal Dimension :  1.01

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