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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107627
Cell Name :  X043_S3_Z1_C01
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-01-03
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  X043_S3_Z1_C01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cross-Regional Gradient of Dendritic Morphology in Isochronically-Sourced Mouse Supragranular Pyramidal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  122.75 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  44
Overall Width :  148.11 μm
Overall Height :  183.68 μm
Overall Depth :  37.78 μm
Average Diameter :  1.78 μm
Total Length :  1739.75 μm
Total Surface :  9818.52 μm2
Total Volume :  4627.01 μm3
Max Euclidean Distance :  136.33 μm
Max Path Distance :  167.83 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  541
Partition Asymmetry :  0.51
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  15.07°
Average Bifurcation Angle Remote :  43.91°
Fractal Dimension :  1.02

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