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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107638
Cell Name :  X041_S7_Z2_C01
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-01-03
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  X041_S7_Z2_C01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cross-Regional Gradient of Dendritic Morphology in Isochronically-Sourced Mouse Supragranular Pyramidal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  115.88 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  29
Number of Branches :  64
Overall Width :  357.55 μm
Overall Height :  264.43 μm
Overall Depth :  36.01 μm
Average Diameter :  2.01 μm
Total Length :  2550.66 μm
Total Surface :  16294.2 μm2
Total Volume :  8798.87 μm3
Max Euclidean Distance :  277.37 μm
Max Path Distance :  287.48 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  791
Partition Asymmetry :  0.44
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  21.61°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.38°
Fractal Dimension :  1.01

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