8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107635
Cell Name :  X041_S5_Z2_C01
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-01-03
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  X041_S5_Z2_C01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cross-Regional Gradient of Dendritic Morphology in Isochronically-Sourced Mouse Supragranular Pyramidal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  80.19 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  17
Number of Branches :  40
Overall Width :  164.22 μm
Overall Height :  255.84 μm
Overall Depth :  38.3 μm
Average Diameter :  1.96 μm
Total Length :  1362.11 μm
Total Surface :  8483.43 μm2
Total Volume :  4476.73 μm3
Max Euclidean Distance :  202.35 μm
Max Path Distance :  211.98 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.96
Total Fragmentation :  421
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  2.02
Average Bifurcation Angle Local :  57.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.32°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website