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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107623
Cell Name :  X041_S5_Z1_C02
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-01-03
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  X041_S5_Z1_C02.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cross-Regional Gradient of Dendritic Morphology in Isochronically-Sourced Mouse Supragranular Pyramidal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  108.08 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  33
Number of Branches :  71
Overall Width :  132.22 μm
Overall Height :  336.23 μm
Overall Depth :  32.94 μm
Average Diameter :  1.85 μm
Total Length :  2616.27 μm
Total Surface :  15383.5 μm2
Total Volume :  7604.49 μm3
Max Euclidean Distance :  254.59 μm
Max Path Distance :  265.12 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  815
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  18.35°
Average Bifurcation Angle Remote :  54.56°
Fractal Dimension :  1.01

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