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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_107653
Cell Name :  X041_S3_Z1_C01
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-01-03
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  X041_S3_Z1_C01.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cross-Regional Gradient of Dendritic Morphology in Isochronically-Sourced Mouse Supragranular Pyramidal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  84.96 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  26
Number of Branches :  57
Overall Width :  243.98 μm
Overall Height :  292.52 μm
Overall Depth :  30.4 μm
Average Diameter :  1.83 μm
Total Length :  2376.69 μm
Total Surface :  13689.4 μm2
Total Volume :  6533.92 μm3
Max Euclidean Distance :  259.3 μm
Max Path Distance :  293.96 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.93
Total Fragmentation :  734
Partition Asymmetry :  0.34
Average Rall's Ratio :  1.93
Average Bifurcation Angle Local :  17.78°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.97°
Fractal Dimension :  1.01

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