8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_150643
Cell Name :  X021-S6-Z3-C02-exported-000
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6-Itgb3tm1.1Wlbcr/J x h B6.129S2-Emx1tm1(cre)Krj/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Integrin subunit beta 3 (Itgb3) Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2021-01-06
Date of Upload :  2021-02-18
Persistence Vector :  X021-S6-Z3-C02-exported-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Integrin β3 organizes dendritic complexity of cerebral cortical pyramidal neurons along a tangential gradient.

Measurements
Soma Surface :  143.3 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  20
Number of Branches :  49
Overall Width :  140.77 μm
Overall Height :  249.71 μm
Overall Depth :  28.14 μm
Average Diameter :  1.64 μm
Total Length :  2009.84 μm
Total Surface :  10726.2 μm2
Total Volume :  4883.86 μm3
Max Euclidean Distance :  190.84 μm
Max Path Distance :  223.08 μm
Max Branch Order :  4
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  726
Partition Asymmetry :  0.36
Average Rall's Ratio :  2.04
Average Bifurcation Angle Local :  29.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  69.12°
Fractal Dimension :  1.02

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