8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_150630
Cell Name :  X021-S6-Z2-C01-exported-000
Archive Name :  Vidal
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6-Itgb3tm1.1Wlbcr/J x h B6.129S2-Emx1tm1(cre)Krj/J
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  23.0 days
Max Age :  23.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  layer 2-3
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Integrin subunit beta 3 (Itgb3) Knockout
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2021-01-06
Date of Upload :  2021-02-18
Persistence Vector :  X021-S6-Z2-C01-exported-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Integrin β3 organizes dendritic complexity of cerebral cortical pyramidal neurons along a tangential gradient.

Measurements
Soma Surface :  120.08 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  23
Number of Branches :  52
Overall Width :  122.1 μm
Overall Height :  221.33 μm
Overall Depth :  34.48 μm
Average Diameter :  1.62 μm
Total Length :  1655.18 μm
Total Surface :  8575.8 μm2
Total Volume :  3772.65 μm3
Max Euclidean Distance :  173.2 μm
Max Path Distance :  205.85 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  548
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.81
Average Bifurcation Angle Local :  68.73°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.33°
Fractal Dimension :  1.03

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