8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_66764
Cell Name :  WT3_2
Archive Name :  Newbern
Species Name :  mouse
Strain :  transgenic
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  17.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  40 grams
Max Weight :  42 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  layer 2-3
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-01-16
Date of Upload :  2017-07-19
Persistence Vector :  WT3_2.pvec
Note :  Animals were mixed, Mek1-/-, Mek2loxp/wt or Mek1-/- Mek2loxp/loxp

Reference Article
Related Article Reference :  Layer specific and general requirements for ERK/MAPK signaling in the developing neocortex.

Measurements
Soma Surface :  986.95 μm2
Number of Stems :  7
Number of Bifurcations :  43
Number of Branches :  93
Overall Width :  263.05 μm
Overall Height :  321.31 μm
Overall Depth :  78.27 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  4479.72 μm
Total Surface :  28146.9 μm2
Total Volume :  14073.4 μm3
Max Euclidean Distance :  329.05 μm
Max Path Distance :  501.37 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  2549
Partition Asymmetry :  0.41
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  88.69°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.75°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website