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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102222
Cell Name :  WT-set3-007
Archive Name :  Southam
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.5 days
Max Age :  15.5 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Microtubule-associated protein 2 (MAP2)-positive
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-07-31
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  WT-set3-007.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Knockout of Amyloid beta Protein Precursor (APP) Expression Alters Synaptogenesis, Neurite Branching and Axonal Morphology of Hippocampal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  1339.77 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  27
Number of Branches :  62
Overall Width :  254.47 μm
Overall Height :  309.11 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.35 μm
Total Length :  2108.58 μm
Total Surface :  2292.01 μm2
Total Volume :  198.26 μm3
Max Euclidean Distance :  212.88 μm
Max Path Distance :  285.3 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1084
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  47.98°
Average Bifurcation Angle Remote :  52.2°
Fractal Dimension :  1.01

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