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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102211
Cell Name :  WT-set2-004
Archive Name :  Southam
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.5 days
Max Age :  15.5 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Microtubule-associated protein 2 (MAP2)-positive
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-07-31
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  WT-set2-004.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Knockout of Amyloid beta Protein Precursor (APP) Expression Alters Synaptogenesis, Neurite Branching and Axonal Morphology of Hippocampal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  940.9 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  40
Number of Branches :  86
Overall Width :  214.19 μm
Overall Height :  277.69 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.35 μm
Total Length :  3113.25 μm
Total Surface :  3384.07 μm2
Total Volume :  292.72 μm3
Max Euclidean Distance :  177.9 μm
Max Path Distance :  239.59 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1619
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  48.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  57.44°
Fractal Dimension :  1.01

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