8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_102208
Cell Name :  WT-set2-001
Archive Name :  Southam
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  15.5 days
Max Age :  15.5 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Microtubule-associated protein 2 (MAP2)-positive
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-07-31
Date of Upload :  2018-11-27
Persistence Vector :  WT-set2-001.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Knockout of Amyloid beta Protein Precursor (APP) Expression Alters Synaptogenesis, Neurite Branching and Axonal Morphology of Hippocampal Neurons.

Measurements
Soma Surface :  2262.5 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  28
Number of Branches :  62
Overall Width :  243.39 μm
Overall Height :  294.41 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.35 μm
Total Length :  2441.4 μm
Total Surface :  2653.78 μm2
Total Volume :  229.55 μm3
Max Euclidean Distance :  216.34 μm
Max Path Distance :  367.89 μm
Max Branch Order :  8
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  1246
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  59.72°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.8°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website