8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_79549
Cell Name :  WT-iPS-derived-cell-5R
Archive Name :  Tarusawa
Species Name :  mouse
Strain :  Wildtype
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  18.0 days
Max Age :  20.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  barrel, layer 4
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  stellate
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-12
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  WT-iPS-derived-cell-5R.pvec
Note :  induced pluripotent stem cell

Reference Article
Related Article Reference :  Establishment of high reciprocal connectivity between clonal cortical neurons is regulated by the Dnmt3b DNA methyltransferase and clustered protocadherins.

Measurements
Soma Surface :  235.44 μm2
Number of Stems :  3
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  31
Overall Width :  177.52 μm
Overall Height :  209.88 μm
Overall Depth :  58.87 μm
Average Diameter :  1.53 μm
Total Length :  1460.17 μm
Total Surface :  7192.35 μm2
Total Volume :  3271.45 μm3
Max Euclidean Distance :  171.63 μm
Max Path Distance :  190.06 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  795
Partition Asymmetry :  0.46
Average Rall's Ratio :  2.76
Average Bifurcation Angle Local :  61.6°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.39°
Fractal Dimension :  1.02

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