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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_251972
Cell Name :  WT-cell4_1
Archive Name :  Qiu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  22.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Avidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2023-01-03
Date of Upload :  2023-01-17
Persistence Vector :  WT-cell4_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Disrupted Maturation of Prefrontal Layer 5 Neuronal Circuits in an Alzheimer''s Mouse Model of Amyloid Deposition.

Measurements
Soma Surface :  1073.44 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  58
Number of Branches :  126
Overall Width :  402.74 μm
Overall Height :  854.83 μm
Overall Depth :  105.97 μm
Average Diameter :  0.83 μm
Total Length :  9668.88 μm
Total Surface :  25043.6 μm2
Total Volume :  5541.6 μm3
Max Euclidean Distance :  654.9 μm
Max Path Distance :  811.51 μm
Max Branch Order :  19
Average Contraction :  0.91
Total Fragmentation :  953
Partition Asymmetry :  0.48
Average Rall's Ratio :  1.71
Average Bifurcation Angle Local :  66.62°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.08°
Fractal Dimension :  1.03

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