8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_251969
Cell Name :  WT-cell3_1
Archive Name :  Qiu
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  22.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  prefrontal
Tertiary Brain Region :  layer 5
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Avidin-Alexa Fluor 488
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  350  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2023-01-03
Date of Upload :  2023-01-17
Persistence Vector :  WT-cell3_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Disrupted Maturation of Prefrontal Layer 5 Neuronal Circuits in an Alzheimer''s Mouse Model of Amyloid Deposition.

Measurements
Soma Surface :  1174.69 μm2
Number of Stems :  12
Number of Bifurcations :  45
Number of Branches :  102
Overall Width :  320.51 μm
Overall Height :  803.29 μm
Overall Depth :  99.31 μm
Average Diameter :  1.03 μm
Total Length :  6839.98 μm
Total Surface :  21924.8 μm2
Total Volume :  6063.1 μm3
Max Euclidean Distance :  710.17 μm
Max Path Distance :  864.41 μm
Max Branch Order :  22
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  801
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.69
Average Bifurcation Angle Local :  74.2°
Average Bifurcation Angle Remote :  71.16°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website