8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_265452
Cell Name :  WT-72-slice-1-NT-000
Archive Name :  Skiteva_Chergui
Species Name :  mouse
Strain :  Nurr1
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 months
Max Age :  8.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  basal ganglia
Secondary Brain Region :  substantia nigra
Tertiary Brain Region :  pars compacta
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  dopaminergic
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Simple Neurite Tracer.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin, Streptavidin-Alexa 488
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  200  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  Simple Neurite Tracer
Date of Deposition :  2023-05-10
Date of Upload :  2023-05-19
Persistence Vector :  WT-72-slice-1-NT-000.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Aberrant somatic calcium channel function in cNurr1 and LRRK2-G2019S mice.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  26
Overall Width :  1053.19 μm
Overall Height :  2138.39 μm
Overall Depth :  48 μm
Average Diameter :  0.25 μm
Total Length :  8018.32 μm
Total Surface :  6297.57 μm2
Total Volume :  393.6 μm3
Max Euclidean Distance :  2001.54 μm
Max Path Distance :  2238.25 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  6528
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  53.94°
Average Bifurcation Angle Remote :  60.73°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website