8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02739
Cell Name :  Vn06202006-0-D
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Incomplete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Mag-indo-1 AM
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  Vn06202006-0-D.pvec
Note :  Only axon
 

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits

Measurements
Soma Surface :  645.83 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  37
Number of Branches :  76
Overall Width :  952.79 μm
Overall Height :  1078.17 μm
Overall Depth :  44.89 μm
Average Diameter :  0.34 μm
Total Length :  5126.26 μm
Total Surface :  5698.84 μm2
Total Volume :  623.89 μm3
Max Euclidean Distance :  1045.72 μm
Max Path Distance :  1408.17 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  12306
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  1.89
Average Bifurcation Angle Local :  96.77°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.9°
Fractal Dimension :  1.05

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