8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02709
Cell Name :  Vn04042006-0-D
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  No Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Mag-indo-1 AM
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  Vn04042006-0-D.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits

Measurements
Soma Surface :  513.85 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  38
Number of Branches :  77
Overall Width :  328.97 μm
Overall Height :  716.51 μm
Overall Depth :  41.14 μm
Average Diameter :  0.3 μm
Total Length :  4646.16 μm
Total Surface :  4499.54 μm2
Total Volume :  386.56 μm3
Max Euclidean Distance :  566.86 μm
Max Path Distance :  1144.58 μm
Max Branch Order :  14
Average Contraction :  0.76
Total Fragmentation :  12396
Partition Asymmetry :  0.55
Average Rall's Ratio :  1.97
Average Bifurcation Angle Local :  89.31°
Average Bifurcation Angle Remote :  77.59°
Fractal Dimension :  1.08

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