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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02685
Cell Name :  Vn01232006-0-A
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Mag-indo-1 AM
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  Vn01232006-0-A.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits

Measurements
Soma Surface :  1260.41 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  57
Number of Branches :  122
Overall Width :  1121.36 μm
Overall Height :  1216.45 μm
Overall Depth :  38.09 μm
Average Diameter :  0.46 μm
Total Length :  9169.09 μm
Total Surface :  13309.5 μm2
Total Volume :  2164.69 μm3
Max Euclidean Distance :  1011.52 μm
Max Path Distance :  1263.82 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  29374
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.56
Average Bifurcation Angle Local :  76.82°
Average Bifurcation Angle Remote :  61.67°
Fractal Dimension :  1.02

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