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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_02721
Cell Name :  VN051305-a
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  12.0 days
Max Age :  15.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Mag-indo-1 AM
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2008-02-06
Date of Upload :  2008-07-15
Persistence Vector :  VN051305-a.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Two-photon photostimulation and imaging of neural circuits

Measurements
Soma Surface :  1137.17 μm2
Number of Stems :  8
Number of Bifurcations :  160
Number of Branches :  328
Overall Width :  542.65 μm
Overall Height :  1137.13 μm
Overall Depth :  54.5 μm
Average Diameter :  0.3 μm
Total Length :  19987.09 μm
Total Surface :  20715.5 μm2
Total Volume :  3049.28 μm3
Max Euclidean Distance :  743.38 μm
Max Path Distance :  1079.71 μm
Max Branch Order :  24
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  10076
Partition Asymmetry :  0.52
Average Rall's Ratio :  1.57
Average Bifurcation Angle Local :  72.53°
Average Bifurcation Angle Remote :  73.86°
Fractal Dimension :  1.09

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