8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_140250
Cell Name :  Untreated
Archive Name :  Zeiser
Species Name :  mouse
Strain :  BALB/c
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Female
Min Weight :  17 grams
Max Weight :  20 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Imaris.ims
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  30  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Imaris
Date of Deposition :  2020-07-03
Date of Upload :  2020-09-30
Persistence Vector :  Untreated.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Graft-versus-host disease of the CNS is mediated by TNF upregulation in microglia.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  96
Number of Branches :  194
Overall Width :  21.78 μm
Overall Height :  61.13 μm
Overall Depth :  33.86 μm
Average Diameter :  1.21 μm
Total Length :  852.81 μm
Total Surface :  3518.51 μm2
Total Volume :  1582.32 μm3
Max Euclidean Distance :  36.51 μm
Max Path Distance :  49.29 μm
Max Branch Order :  15
Average Contraction :  0.98
Total Fragmentation :  2241
Partition Asymmetry :  0.45
Average Rall's Ratio :  1.96
Average Bifurcation Angle Local :  84.57°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.13°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website