8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_111001
Cell Name :  Unprocessed_J519_mPFC
Archive Name :  Jensen
Species Name :  mouse
Strain :  En1::2ADre;Dbh::Flpo;RC::RFLTG
Structural Domains :  No Dendrites, No Soma, Axon
Physical Integrity :  Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  Not reported
Max Age :  Not reported
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  pons
Secondary Brain Region :  pontine tegmentum
Tertiary Brain Region :  Locus Coeruleus
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Noradrenergic
Tertiary Cell Class :  mPFC/A24-projecting
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  40  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2019-03-26
Date of Upload :  2019-08-19
Persistence Vector :  Unprocessed_J519_mPFC.pvec
Note :  AAV cre injected

Reference Article
Related Article Reference :  DEFiNE: A Method for Enhancement and Quantification of Fluorescently Labeled Axons.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  60
Number of Branches :  121
Overall Width :  670.18 μm
Overall Height :  682.86 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  6310.38 μm
Total Surface :  19824.6 μm2
Total Volume :  4956.16 μm3
Max Euclidean Distance :  763.5 μm
Max Path Distance :  2061.79 μm
Max Branch Order :  25
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  1000
Partition Asymmetry :  0.73
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  128.01°
Average Bifurcation Angle Remote :  122.12°
Fractal Dimension :  1.01

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