8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132832
Cell Name :  T_181102_8_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-Lhx9
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  left
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  T_181102_8_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  449.7 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  39
Overall Width :  103.83 μm
Overall Height :  244.19 μm
Overall Depth :  155.2 μm
Average Diameter :  3.48 μm
Total Length :  1440.03 μm
Total Surface :  16118.5 μm2
Total Volume :  15666.5 μm3
Max Euclidean Distance :  231.03 μm
Max Path Distance :  635.63 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.84
Total Fragmentation :  461
Partition Asymmetry :  0.59
Average Rall's Ratio :  1.95
Average Bifurcation Angle Local :  76.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.25°
Fractal Dimension :  1.08

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website