8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_132458
Cell Name :  T_180201_8_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-vGlut2a
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  T_180201_8_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1008.24 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  7
Number of Branches :  15
Overall Width :  90.73 μm
Overall Height :  247.09 μm
Overall Depth :  84.62 μm
Average Diameter :  3.78 μm
Total Length :  622.09 μm
Total Surface :  7943.7 μm2
Total Volume :  8989.66 μm3
Max Euclidean Distance :  265.71 μm
Max Path Distance :  493.04 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.82
Total Fragmentation :  190
Partition Asymmetry :  0.64
Average Rall's Ratio :  1.93
Average Bifurcation Angle Local :  80.45°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.85°
Fractal Dimension :  1.06

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website