8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133274
Cell Name :  T_180111_4_2
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  right
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  T_180111_4_2.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  861.54 μm2
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  11
Overall Width :  107.29 μm
Overall Height :  258.06 μm
Overall Depth :  55.34 μm
Average Diameter :  4.76 μm
Total Length :  504.08 μm
Total Surface :  7866.77 μm2
Total Volume :  10670.5 μm3
Max Euclidean Distance :  251.5 μm
Max Path Distance :  401.77 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  149
Partition Asymmetry :  0.8
Average Rall's Ratio :  3.53
Average Bifurcation Angle Local :  72.75°
Average Bifurcation Angle Remote :  74.35°
Fractal Dimension :  1.06

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