8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_133615
Cell Name :  T_180102_19_1
Archive Name :  Baier
Species Name :  zebrafish
Strain :  Gal4-elavl3
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  6.0 days
Max Age :  6.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  larval
Primary Brain Region :  Central nervous system
Secondary Brain Region :  left
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  neuTube.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  glycerin
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  neuTube
Date of Deposition :  2019-07-03
Date of Upload :  2020-06-29
Persistence Vector :  T_180102_19_1.pvec
Note :  6 days post fertilization

Reference Article
Related Article Reference :  A Cellular-Resolution Atlas of the Larval Zebrafish Brain.

Measurements
Soma Surface :  1031.3 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  45
Number of Branches :  95
Overall Width :  117.12 μm
Overall Height :  296.45 μm
Overall Depth :  97.53 μm
Average Diameter :  4.49 μm
Total Length :  1502.42 μm
Total Surface :  23350.8 μm2
Total Volume :  33504.3 μm3
Max Euclidean Distance :  303.3 μm
Max Path Distance :  437.11 μm
Max Branch Order :  17
Average Contraction :  0.87
Total Fragmentation :  446
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  2.29
Average Bifurcation Angle Local :  89.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  85.01°
Fractal Dimension :  1.06

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