8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07238
Cell Name :  TS060408s2cell2
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  GIN
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  10.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  Not reported
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  TS060408s2cell2.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory, frontal or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Quantitative classification of somatostatin-positive neocortical interneurons identifies three interneuron subtypes.

Measurements
Soma Surface :  384.73 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  39
Number of Branches :  83
Overall Width :  134.77 μm
Overall Height :  224.63 μm
Overall Depth :  11.95 μm
Average Diameter :  0.31 μm
Total Length :  2259.25 μm
Total Surface :  2189.42 μm2
Total Volume :  409.59 μm3
Max Euclidean Distance :  172.5 μm
Max Path Distance :  195.52 μm
Max Branch Order :  6
Average Contraction :  0.9
Total Fragmentation :  4279
Partition Asymmetry :  0.49
Average Rall's Ratio :  1.34
Average Bifurcation Angle Local :  81.37°
Average Bifurcation Angle Remote :  64.73°
Fractal Dimension :  1.03

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website