8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_07237
Cell Name :  TS060408s2cell1
Archive Name :  Yuste
Species Name :  mouse
Strain :  GIN
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  10.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  Multiple
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 49% in z
Not corrected
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2010-07-29
Date of Upload :  2011-11-08
Persistence Vector :  TS060408s2cell1.pvec
Note :  Secondary brain region- somatosensory, frontal or visual cortex
 

Reference Article
Related Article Reference :  Quantitative classification of somatostatin-positive neocortical interneurons identifies three interneuron subtypes.

Measurements
Soma Surface :  728.36 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  49
Overall Width :  152.07 μm
Overall Height :  234.87 μm
Overall Depth :  13.71 μm
Average Diameter :  0.34 μm
Total Length :  1723.83 μm
Total Surface :  1890.55 μm2
Total Volume :  374.57 μm3
Max Euclidean Distance :  192.48 μm
Max Path Distance :  232.32 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.86
Total Fragmentation :  3289
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  1.05
Average Bifurcation Angle Local :  86.5°
Average Bifurcation Angle Remote :  66.41°
Fractal Dimension :  1.02

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