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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_170670
Cell Name :  TRN-1-CER-488-IBA1-594-3-2
Archive Name :  Xiong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  ventral thalamus
Secondary Brain Region :  thalamic reticular nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2021-09-08
Date of Upload :  2021-12-14
Persistence Vector :  TRN-1-CER-488-IBA1-594-3-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Microglia modulate stable wakefulness via the thalamic reticular nucleus in mice.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  5
Number of Branches :  12
Overall Width :  102.93 μm
Overall Height :  78.46 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  308.44 μm
Total Surface :  969 μm2
Total Volume :  242.25 μm3
Max Euclidean Distance :  98.7 μm
Max Path Distance :  145.64 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.97
Total Fragmentation :  55
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  91.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  113.79°
Fractal Dimension :  1.01

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