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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_170262
Cell Name :  TRN-1-CER-488-IBA1-594-2-2
Archive Name :  Xiong
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Processes, No Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  5.0 months
Gender :  Male/Female
Min Weight :  20 grams
Max Weight :  30 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  ventral thalamus
Secondary Brain Region :  thalamic reticular nucleus
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  60  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  60x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2021-09-08
Date of Upload :  2021-12-14
Persistence Vector :  TRN-1-CER-488-IBA1-594-2-2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Microglia modulate stable wakefulness via the thalamic reticular nucleus in mice.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  14
Number of Branches :  29
Overall Width :  159.71 μm
Overall Height :  158.66 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  734.58 μm
Total Surface :  2307.74 μm2
Total Volume :  576.94 μm3
Max Euclidean Distance :  167.03 μm
Max Path Distance :  341.41 μm
Max Branch Order :  9
Average Contraction :  0.95
Total Fragmentation :  138
Partition Asymmetry :  0.61
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  138.09°
Average Bifurcation Angle Remote :  124.1°
Fractal Dimension :  1.03

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