8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_104019
Cell Name :  TREATED3
Archive Name :  Pinto
Species Name :  mouse
Strain :  CD1
Structural Domains :  Dendrites, No Soma, No Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  7.0 days
Max Age :  7.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  young
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  glutamatergic, Spiny, Star
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Negr1 shRNA
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  80  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  63x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2018-10-25
Date of Upload :  2019-04-08
Persistence Vector :  TREATED3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  NEGR1 and FGFR2 cooperatively regulate cortical development and core behaviours related to autism disorders in mice.

Measurements
Soma Surface :  N/A
Number of Stems :  1
Number of Bifurcations :  18
Number of Branches :  37
Overall Width :  737.77 μm
Overall Height :  1011.52 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  1 μm
Total Length :  3856.7 μm
Total Surface :  12116.2 μm2
Total Volume :  3029.04 μm3
Max Euclidean Distance :  968.74 μm
Max Path Distance :  1368.43 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  695
Partition Asymmetry :  0.77
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  111.24°
Average Bifurcation Angle Remote :  97.16°
Fractal Dimension :  1.02

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website