8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_77925
Cell Name :  TR050319_4_IDD
Archive Name :  Markram
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  14.0 days
Max Age :  18.0 days
Gender :  Not reported
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  not reported
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.asc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  biocytin
Slicing Direction :  parasagittal
Slice Thickness :  300  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2015-03-06
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  TR050319_4_IDD.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Cell type- and activity-dependent extracellular correlates of intracellular spiking.

Measurements
Soma Surface :  1837.63 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  91
Number of Branches :  187
Overall Width :  763.09 μm
Overall Height :  1434.9 μm
Overall Depth :  145.21 μm
Average Diameter :  0.56 μm
Total Length :  16328.7 μm
Total Surface :  34425.2 μm2
Total Volume :  11670.8 μm3
Max Euclidean Distance :  1226.59 μm
Max Path Distance :  1338.08 μm
Max Branch Order :  12
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  12935
Partition Asymmetry :  0.42
Average Rall's Ratio :  1.08
Average Bifurcation Angle Local :  69.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  56.19°
Fractal Dimension :  1.05

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