8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_35830
Cell Name :  TF29-PV-basket-cell
Archive Name :  Klausberger
Species Name :  rat
Strain :  Sprague-Dawley
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  3.0 months
Max Age :  3.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  300 grams
Max Weight :  500 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  CA1
Tertiary Brain Region :  pyramidal layer, posterior
Primary Cell Class :  interneuron
Secondary Cell Class :  basket
Tertiary Cell Class :  Parvalbumin (PV)-positive, ErbB4-positive, Somatostatin (SOM)-negative, Neuropeptide Y (NPY)-negative, Cholecystokinin (CCK)-negative
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Neurobiotin
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  70  μm
Tissue Shrinkage :  Reported (no values given)
Corrected (no values given)
Objective Type :  oil
Magnification :  100x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2014-01-13
Date of Upload :  2016-03-04
Persistence Vector :  TF29-PV-basket-cell.pvec
Note :  Max Age is unknown, displaying same value as in Min Age

Reference Article
Related Article Reference :  Temporal organization of GABAergic interneurons in the intermediate CA1 hippocampus during network oscillations.

Measurements
Soma Surface :  2214.19 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  263
Number of Branches :  530
Overall Width :  590.2 μm
Overall Height :  654.75 μm
Overall Depth :  613.71 μm
Average Diameter :  0.72 μm
Total Length :  18076.2 μm
Total Surface :  42357.3 μm2
Total Volume :  10322.9 μm3
Max Euclidean Distance :  742.59 μm
Max Path Distance :  1547.18 μm
Max Branch Order :  38
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  6693
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.79
Average Bifurcation Angle Local :  88.79°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.46°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website