8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_255465
Cell Name :  TDIE1301a007_Cell28
Archive Name :  Zeng
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Amira.swc
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2023-02-12
Date of Upload :  2023-03-14
Persistence Vector :  TDIE1301a007_Cell28.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical sectioning fluorescence tomography: high-throughput, high-contrast, multicolor, whole-brain imaging at subcellular resolution.

Measurements
Soma Surface :  1216.65 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  973
Number of Branches :  1952
Overall Width :  1814.53 μm
Overall Height :  4109.04 μm
Overall Depth :  1123.87 μm
Average Diameter :  0.31 μm
Total Length :  50485.1 μm
Total Surface :  44839.4 μm2
Total Volume :  4295.56 μm3
Max Euclidean Distance :  4069.72 μm
Max Path Distance :  5144.47 μm
Max Branch Order :  53
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  8913
Partition Asymmetry :  0.79
Average Rall's Ratio :  5.41
Average Bifurcation Angle Local :  76.42°
Average Bifurcation Angle Remote :  83.14°
Fractal Dimension :  1.01

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