8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_255442
Cell Name :  TDIE1301a007_Cell2
Archive Name :  Zeng
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Amira.am
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2023-02-12
Date of Upload :  2023-03-14
Persistence Vector :  TDIE1301a007_Cell2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical sectioning fluorescence tomography: high-throughput, high-contrast, multicolor, whole-brain imaging at subcellular resolution.

Measurements
Soma Surface :  3061.1 μm2
Number of Stems :  13
Number of Bifurcations :  664
Number of Branches :  1341
Overall Width :  5211.72 μm
Overall Height :  3326.04 μm
Overall Depth :  2299.47 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  93996.2 μm
Total Surface :  590604 μm2
Total Volume :  295307 μm3
Max Euclidean Distance :  3651.63 μm
Max Path Distance :  8290.74 μm
Max Branch Order :  32
Average Contraction :  0.92
Total Fragmentation :  13581
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  32.64°
Average Bifurcation Angle Remote :  68.52°
Fractal Dimension :  1.02

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