8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_255448
Cell Name :  TDIE1301a007_Cell17
Archive Name :  Zeng
Species Name :  mouse
Strain :  Thy1-GFP-M
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites & Axon Complete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  2.0 months
Gender :  Male
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  somatosensory
Tertiary Brain Region :  primary somatosensory
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Amira.am
Experiment Protocol :  in vitro
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  transverse
Slice Thickness :  Not reported
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  water
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Amira
Date of Deposition :  2023-02-12
Date of Upload :  2023-03-14
Persistence Vector :  TDIE1301a007_Cell17.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Chemical sectioning fluorescence tomography: high-throughput, high-contrast, multicolor, whole-brain imaging at subcellular resolution.

Measurements
Soma Surface :  124.8 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  325
Number of Branches :  655
Overall Width :  341.82 μm
Overall Height :  860.29 μm
Overall Depth :  489.87 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  25121.2 μm
Total Surface :  157841 μm2
Total Volume :  78920.6 μm3
Max Euclidean Distance :  599.44 μm
Max Path Distance :  1637.52 μm
Max Branch Order :  32
Average Contraction :  0.89
Total Fragmentation :  17285
Partition Asymmetry :  0.69
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  19.55°
Average Bifurcation Angle Remote :  76.44°
Fractal Dimension :  1.03

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