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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78451
Cell Name :  Sub02
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  29.0 days
Max Age :  31.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  115 grams
Max Weight :  130 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Pilocarpine-induced epilepsy
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  450  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  Sub02.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Widespread activation of microglial cells in the hippocampus of chronic epileptic rats correlates only partially with neurodegeneration.

Measurements
Soma Surface :  93.67 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  6
Number of Branches :  22
Overall Width :  47.79 μm
Overall Height :  32.62 μm
Overall Depth :  3.05 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  248.28 μm
Total Surface :  431.52 μm2
Total Volume :  73.6 μm3
Max Euclidean Distance :  37.76 μm
Max Path Distance :  42.92 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  221
Partition Asymmetry :  0.58
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  73.66°
Average Bifurcation Angle Remote :  81.87°
Fractal Dimension :  1.05

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