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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78448
Cell Name :  Sub-03_2
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  29.0 days
Max Age :  31.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  115 grams
Max Weight :  130 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Pilocarpine-induced epilepsy
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  450  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  Sub-03_2.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Widespread activation of microglial cells in the hippocampus of chronic epileptic rats correlates only partially with neurodegeneration.

Measurements
Soma Surface :  459.04 μm2
Number of Stems :  11
Number of Bifurcations :  12
Number of Branches :  35
Overall Width :  47.53 μm
Overall Height :  38.52 μm
Overall Depth :  2.54 μm
Average Diameter :  0.78 μm
Total Length :  458.32 μm
Total Surface :  1138.35 μm2
Total Volume :  243.76 μm3
Max Euclidean Distance :  32 μm
Max Path Distance :  54.02 μm
Max Branch Order :  3
Average Contraction :  0.85
Total Fragmentation :  463
Partition Asymmetry :  0.21
Average Rall's Ratio :  1.33
Average Bifurcation Angle Local :  75.34°
Average Bifurcation Angle Remote :  59.34°
Fractal Dimension :  1.06

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