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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_78445
Cell Name :  Sub-02_1
Archive Name :  Papageorgiou_Kann
Species Name :  rat
Strain :  Wistar
Structural Domains :  Processes, Soma
Physical Integrity :  Processes Moderate
Morphological Attributes :  Diameter, 2D, Angles
Min Age :  29.0 days
Max Age :  31.0 days
Gender :  Male
Min Weight :  115 grams
Max Weight :  130 grams
Development :  young adult
Primary Brain Region :  subiculum
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  Glia
Secondary Cell Class :  microglia
Tertiary Cell Class :  Iba1-positive
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  ex vivo
Experimental Condition :  Pilocarpine-induced epilepsy
Staining Method :  immunostaining
Slicing Direction :  horizontal
Slice Thickness :  450  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2017-06-18
Date of Upload :  2017-11-28
Persistence Vector :  Sub-02_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Widespread activation of microglial cells in the hippocampus of chronic epileptic rats correlates only partially with neurodegeneration.

Measurements
Soma Surface :  262.61 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  19
Number of Branches :  47
Overall Width :  60.94 μm
Overall Height :  40.72 μm
Overall Depth :  0.6 μm
Average Diameter :  0.99 μm
Total Length :  483.74 μm
Total Surface :  1496.44 μm2
Total Volume :  410 μm3
Max Euclidean Distance :  34.88 μm
Max Path Distance :  50.49 μm
Max Branch Order :  7
Average Contraction :  0.83
Total Fragmentation :  638
Partition Asymmetry :  0.4
Average Rall's Ratio :  1.59
Average Bifurcation Angle Local :  102.57°
Average Bifurcation Angle Remote :  78.35°
Fractal Dimension :  1.08

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