8.6.82 - Released: 2025-05-21 - Content: 275062 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_139813
Cell Name :  Snap-4_1
Archive Name :  Lanoue
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6J
Structural Domains :  Neurites, Soma
Physical Integrity :  Neurites Moderate
Morphological Attributes :  No Diameter, 2D, Angles
Min Age :  28.0 days
Max Age :  28.0 days
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  embryonic
Primary Brain Region :  hippocampus
Secondary Brain Region :  Not reported
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  NeuronJ.ndf
Experiment Protocol :  culture
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  green fluorescent protein
Slicing Direction :  Not applicable
Slice Thickness :  Not applicable
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  NeuronJ
Date of Deposition :  2020-08-31
Date of Upload :  2020-09-21
Persistence Vector :  Snap-4_1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  The Wnt receptor Ryk is a negative regulator of mammalian dendrite morphogenesis.

Measurements
Soma Surface :  4374.97 μm2
Number of Stems :  9
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  53
Overall Width :  917.65 μm
Overall Height :  342.72 μm
Overall Depth :  0 μm
Average Diameter :  0.5 μm
Total Length :  3624.01 μm
Total Surface :  5692.59 μm2
Total Volume :  711.57 μm3
Max Euclidean Distance :  759.17 μm
Max Path Distance :  977.37 μm
Max Branch Order :  5
Average Contraction :  0.94
Total Fragmentation :  627
Partition Asymmetry :  0.53
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  99.62°
Average Bifurcation Angle Remote :  100.3°
Fractal Dimension :  1.01

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website