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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_173316
Cell Name :  Sholl-analysis-blindB8-s10-A-right-tt-v1-exp3
Archive Name :  Mehder
Species Name :  mouse
Strain :  C57BL/6
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 year
Max Age :  1.0 year
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Control
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-11-22
Date of Upload :  2022-01-13
Persistence Vector :  Sholl-analysis-blindB8-s10-A-right-tt-v1-exp3.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphometric Analysis of Hippocampal and Neocortical Pyramidal Neurons in a Mouse Model of Late Onset Alzheimer's Disease.

Measurements
Soma Surface :  987.54 μm2
Number of Stems :  10
Number of Bifurcations :  22
Number of Branches :  54
Overall Width :  165.53 μm
Overall Height :  334.58 μm
Overall Depth :  68.47 μm
Average Diameter :  0.54 μm
Total Length :  2501.03 μm
Total Surface :  4589.62 μm2
Total Volume :  1184.34 μm3
Max Euclidean Distance :  351.93 μm
Max Path Distance :  389.19 μm
Max Branch Order :  13
Average Contraction :  0.88
Total Fragmentation :  1423
Partition Asymmetry :  0.67
Average Rall's Ratio :  1.62
Average Bifurcation Angle Local :  82.52°
Average Bifurcation Angle Remote :  75.04°
Fractal Dimension :  1.04

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