8.6.79 - Released: 2025-04-16 - Content: 273841 cells
Morphology File (Standardized)
Morphology File (Original)
Log File (Standardized)
Log File (Original)



3D Cell Viewer - Java, legacy
3D Cell Viewer - WebGL, novel
Animation
Similar Neurons
Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_173461
Cell Name :  Sholl-analysis-blind-slide-34-B-right-v1
Archive Name :  Mehder
Species Name :  mouse
Strain :  Aldh2-/-
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Moderate, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  No Diameter, 3D, Angles
Min Age :  1.0 year
Max Age :  1.0 year
Gender :  Male/Female
Min Weight :  Not reported
Max Weight :  Not reported
Development :  adult
Primary Brain Region :  neocortex
Secondary Brain Region :  occipital
Tertiary Brain Region :  primary visual, layer 5, right
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  pyramidal
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neurolucida.dat
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  aldehyde dehydrogenase 2 (ALDH2) knockout
Staining Method :  Golgi-Cox
Slicing Direction :  coronal
Slice Thickness :  150  μm
Tissue Shrinkage :  Not reported
Objective Type :  dry
Magnification :  40x
Reconstruction Method :  Neurolucida
Date of Deposition :  2021-11-22
Date of Upload :  2022-01-13
Persistence Vector :  Sholl-analysis-blind-slide-34-B-right-v1.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Morphometric Analysis of Hippocampal and Neocortical Pyramidal Neurons in a Mouse Model of Late Onset Alzheimer's Disease.

Measurements
Soma Surface :  697.74 μm2
Number of Stems :  6
Number of Bifurcations :  3
Number of Branches :  12
Overall Width :  86.49 μm
Overall Height :  145.95 μm
Overall Depth :  23.9 μm
Average Diameter :  0.68 μm
Total Length :  549.42 μm
Total Surface :  1237.86 μm2
Total Volume :  255.07 μm3
Max Euclidean Distance :  124.65 μm
Max Path Distance :  151.56 μm
Max Branch Order :  2
Average Contraction :  0.79
Total Fragmentation :  346
Partition Asymmetry :  0.33
Average Rall's Ratio :  2
Average Bifurcation Angle Local :  81.63°
Average Bifurcation Angle Remote :  45.23°
Fractal Dimension :  1.05

© Copyright 2006-2025   George Mason University All Rights Reserved.   Link Graphic to NIF website