8.6.103 - Released: 2025-12-08 - Content: 285900 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_87852
Cell Name :  Shi2013_Fig8_G
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Brn3b-/-; Brn3c CKOAP/+
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 20%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2018-03-04
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  Shi2013_Fig8_G.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Genetic interactions between Brn3 transcription factors in retinal ganglion cell type specification.

Measurements
Soma Surface :  518.38 μm2
Number of Stems :  4
Number of Bifurcations :  324
Number of Branches :  652
Overall Width :  157.33 μm
Overall Height :  212.59 μm
Overall Depth :  45.57 μm
Average Diameter :  1.57 μm
Total Length :  7457.86 μm
Total Surface :  37810.8 μm2
Total Volume :  17867.3 μm3
Max Euclidean Distance :  157.93 μm
Max Path Distance :  274.29 μm
Max Branch Order :  29
Average Contraction :  0.77
Total Fragmentation :  4507
Partition Asymmetry :  0.56
Average Rall's Ratio :  1.92
Average Bifurcation Angle Local :  84.74°
Average Bifurcation Angle Remote :  84.4°
Fractal Dimension :  1.12

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