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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_87862
Cell Name :  Shi2013_Fig6_L
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Brn3b-/-; Brn3a CKOAP/-
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 20%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2018-03-04
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  Shi2013_Fig6_L.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Genetic interactions between Brn3 transcription factors in retinal ganglion cell type specification.

Measurements
Soma Surface :  176.87 μm2
Number of Stems :  5
Number of Bifurcations :  133
Number of Branches :  271
Overall Width :  238.17 μm
Overall Height :  218.95 μm
Overall Depth :  50 μm
Average Diameter :  2 μm
Total Length :  7227.53 μm
Total Surface :  46503.3 μm2
Total Volume :  27188.4 μm3
Max Euclidean Distance :  163.52 μm
Max Path Distance :  308.31 μm
Max Branch Order :  11
Average Contraction :  0.75
Total Fragmentation :  3805
Partition Asymmetry :  0.47
Average Rall's Ratio :  1.84
Average Bifurcation Angle Local :  82.36°
Average Bifurcation Angle Remote :  82.84°
Fractal Dimension :  1.1

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