8.6.96 - Released: 2025-11-05 - Content: 284158 cells
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Details about selected cell
NeuroMorpho.Org ID :  NMO_87875
Cell Name :  Shi2013_Fig6_C
Archive Name :  Badea
Species Name :  mouse
Strain :  C57Bl6/129Sv
Structural Domains :  Dendrites, Soma, Axon
Physical Integrity :  Dendrites Complete, Axon Incomplete
Morphological Attributes :  Diameter, 3D, Angles
Min Age :  2.0 months
Max Age :  4.0 months
Gender :  Not reported
Min Weight :  25 grams
Max Weight :  35 grams
Development :  adult
Primary Brain Region :  retina
Secondary Brain Region :  ganglion layer
Tertiary Brain Region :  Not reported
Primary Cell Class :  principal cell
Secondary Cell Class :  ganglion
Tertiary Cell Class :  Not reported
Original Format :  Neuromantic.swc
Experiment Protocol :  in vivo
Experimental Condition :  Brn3b+/-; Brn3a CKOAP/+
Staining Method :  alkaline phosphatase
Slicing Direction :  Not reported
Slice Thickness :  100  μm
Tissue Shrinkage :  Reported 20%
Not corrected
Objective Type :  dry
Magnification :  20x
Reconstruction Method :  Neuromantic
Date of Deposition :  2018-03-04
Date of Upload :  2018-08-02
Persistence Vector :  Shi2013_Fig6_C.pvec

Reference Article
Related Article Reference :  Genetic interactions between Brn3 transcription factors in retinal ganglion cell type specification.

Measurements
Soma Surface :  683.93 μm2
Number of Stems :  2
Number of Bifurcations :  146
Number of Branches :  294
Overall Width :  97.42 μm
Overall Height :  195.91 μm
Overall Depth :  42.37 μm
Average Diameter :  2.02 μm
Total Length :  3946.51 μm
Total Surface :  25367.5 μm2
Total Volume :  14802.3 μm3
Max Euclidean Distance :  144.75 μm
Max Path Distance :  284.29 μm
Max Branch Order :  16
Average Contraction :  0.71
Total Fragmentation :  2178
Partition Asymmetry :  0.54
Average Rall's Ratio :  1.79
Average Bifurcation Angle Local :  82.68°
Average Bifurcation Angle Remote :  86.17°
Fractal Dimension :  1.16

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